Перейти к содержанию

THADA

Материал из Мегавики — свободной энциклопедии
Данная страница не проверялась участниками с соответствующими правами.
THADA
Идентификаторы
ПсевдонимыTHADA, GITA, ARMC13, armadillo repeat containing, THADA armadillo repeat containing, Trm732
Внешние IDOMIM: 611800 MGI: 3039623 HomoloGene: 75175 GeneCards: THADA
Расположение гена (человек)
2-я хромосома человека
Хр.2-я хромосома человека[1]
2-я хромосома человека
Расположение в геноме THADA
Расположение в геноме THADA
Локус2p21Начало43,230,851 bp[1]
Конец43,596,038 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
17-я хромосома мыши
Хр.17-я хромосома мыши[2]
17-я хромосома мыши
Расположение в геноме THADA
Расположение в геноме THADA
Локус17|17 E4Начало84,497,504 bp[2]
Конец84,773,633 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • right uterine tube

  • right lobe of thyroid gland

  • left lobe of thyroid gland

  • sural nerve

  • skin of abdomen

  • right lobe of liver
Наибольшая экспрессия в
  • secondary oocyte
Дополнительные справочные данные
BioGPS
н/д
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

63892

240174

Ensembl

ENSG00000115970

ENSMUSG00000024251

UniProt

Q6YHU6

н/д

RefSeq (мРНК)
NM_001083953
NM_001271643
NM_001271644
NM_022065
NM_001345923

NM_001345924
NM_001345925

NM_177826
NM_183021

RefSeq (белок)
NP_001077422
NP_001258572
NP_001258573
NP_001332852
NP_001332853

NP_001332854
NP_071348

н/д

Локус (UCSC)Chr 2: 43.23 – 43.6 MbChr 17: 84.5 – 84.77 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

THADA (англ. THADA, armadillo repeat containing) – белок, кодируемый одноименным геном, расположенным у людей на коротком плече 2-й хромосомы[5]. Длина полипептидной цепи белка составляет 1 953 аминокислот, а молекулярная масса — 219 607[6] .

Последовательноть аминокислот
1020304050
MGVKKKKEMQVAALTICHQDLETLKSFADVEGKNLASLLLHCVQLTDGVS
QIHYIKQIVPLLEKADKNGMCDPTIQSCLDILAGIYLSLSLKNPLKKVLA
SSLNSLPDFFLPEAMHRFTSRLQEELNTTDLYSYRKVTDNISSCMENFNL
GRASVNNLLKNVLHFLQKSLIEILEENRKCAGNHIIQTQLMNDLLVGIRV
SMMLVQKVQDFQGNLWKTSDSPIWQNMCGLLSIFTKVLSDDDLLQTVQST
SGLAIILFIKTMFHPSEKIPHLISSVLLRSVDCTSVPEWFMSSCRSLCCG
DISQSAVLFLCQGTLAMLDWQNGSMGRSGEALLLDTAHVLFTLSSQIKEP
TLEMFLSRILASWTNSAIQVLESSSPSLTDSLNGNSSIVGRLLEYVYTHW
EHPLDALRHQTKIMFKNLLQMHRLTVEGADFVPDPFFVELTESLLRLEWH
IKGKYTCLGCLVECIGVEHILAIDKTIPSQILEVMGDQSLVPYASDLLET
MFRNHKSHLKSQTAESSWIDQWHETWVSPLLFILCEGNLDQKSYVIDYYL
PKLLSYSPESLQYMVKILQTSIDAKTGQEQSFPSLGSCNSRGALGALMAC
LRIARAHGHLQSATDTWENLVSDARIKQGLIHQHCQVRIDTLGLLCESNR
STEIVSMEEMQWIQFFITYNLNSQSPGVRQQICSLLKKLFCRIQESSQVL
YKLEQSKSKREPENELTKQHPSVSLQQYKNFMSSICNSLFEALFPGSSYS
TRFSALTILGSIAEVFHVPEGRIYTVYQLSHDIDVGRFQTLMECFTSTFE
DVKILAFDLLMKLSKTAVHFQDSGKLQGLFQAALELSTSTKPYDCVTASY
LLNFLIWQDALPSSLSAYLTQQVACDNGDRPAAVVERNTLMVIKCLMENL
EEEVSQAENSLLQAAAAFPMYGRVHCITGALQKLSLNSLQLVSEWRPVVE
KLLLMSYRLSTVVSPVIQSSSPEGLIPMDTDSESASRLQMILNEIQPRDT
NDYFNQAKILKEHDSFDMKDLNASVVNIDTSTEIKGKEVKTCDVTAQMVL
VCCWRSMKEVALLLGMLCQLLPMQPVPESSDGLLTVEQVKEIGDYFKQHL
LQSRHRGAFELAYTGFVKLTEVLNRCPNVSLQKLPEQWLWSVLEEIKCSD
PSSKLCATRRSAGIPFYIQALLASEPKKGRMDLLKITMKELISLAGPTDD
IQSTVPQVHALNILRALFRDTRLGENIIPYVADGAKAAILGFTSPVWAVR
NSSTLLFSALITRIFGVKRAKDEHSKTNRMTGREFFSRFPELYPFLLKQL
ETVANTVDSDMGEPNRHPSMFLLLLVLERLYASPMDGTSSALSMGPFVPF
IMRCGHSPVYHSREMAARALVPFVMIDHIPNTIRTLLSTLPSCTDQCFRQ
NHIHGTLLQVFHLLQAYSDSKHGTNSDFQHELTDITVCTKAKLWLAKRQN
PCLVTRAVYIDILFLLTCCLNRSAKDNQPVLESLGFWEEVRGIISGSELI
TGFPWAFKVPGLPQYLQSLTRLAIAAVWAAAAKSGERETNVPISFSQLLE
SAFPEVRSLTLEALLEKFLAAASGLGEKGVPPLLCNMGEKFLLLAMKENH
PECFCKILKILHCMDPGEWLPQTEHCVHLTPKEFLIWTMDIASNERSEIQ
SVALRLASKVISHHMQTCVENRELIAAELKQWVQLVILSCEDHLPTESRL
AVVEVLTSTTPLFLTNPHPILELQDTLALWKCVLTLLQSEEQAVRDAATE
TVTTAMSQENTCQSTEFAFCQVDASIALALALAVLCDLLQQWDQLAPGLP
ILLGWLLGESDDLVACVESMHQVEEDYLFEKAEVNFWAETLIFVKYLCKH
LFCLLSKSGWRPPSPEMLCHLQRMVSEQCHLLSQFFRELPPAAEFVKTVE
FTRLRIQEERTLACLRLLAFLEGKEGEDTLVLSVWDSYAESRQLTLPRTE
AAC

Кодируемый геном белок по функции относится к фосфопротеинам. Задействован в таких биологических процессах как полиморфизм, альтернативный сплайсинг.

Литература[править]

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). // Genome Res.. — Т. 14. — С. 2121—2127. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примечания[править]

  1. ↑ 1,0 1,1 1,2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000115970 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 2,0 2,1 2,2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000024251 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19217 (англ.). Дата обращения: 29 серпня 2017. Архивировано 8 червня 2016 года.
  6. ↑ UniProt, Q6YHU6 (англ.). Дата обращения: 29 серпня 2017. Архивировано 26 вересня 2017 года.

См. также[править]

Источник — https://megawiki.ru/wiki/THADA